Метод диагностики инфекции и воспалительных процессов по маркерам — специфическим веществам, которые вырабатываются микроорганизмами в процессе их жизнедеятельности. Эти вещества по своему химическому строению отличаются от вещества клеток человека. Например, для человеческого организма характерно чуть более 20 жирных кислот. Для микробов — более 200. Метод хромато-масс-спектрометрии является достаточно чувствительным, чтобы определить наличие микробов в организме человека по химической природе исследуемых маркеров.